При формировании схемы в сводной таблице соединений появляются пустые линии в перечне соединенных аппаратов, которым при маркировке присваиваются номера. Видимо это от каких-то линий связи, которые могут быть и не видны. Как от них избавиться ?
Обратитесь в службу технической поддержки - http://support.ascon.ru/request/
Там будет необходимо прикрепить ваш проект.